Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Urb2E9Q7L1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms