Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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