Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Rsf1E9PWW9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsf1E9PWW9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms