Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a3E9PWQ3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a3E9PWQ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms