Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30bE9PVL6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30bE9PVL6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms