Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5478D3Z6R0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5478D3Z6R0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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