Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms