Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm5930D3Z257 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm5930D3Z257 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5930D3Z257 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm5930D3Z257 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm5930D3Z257 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm5930D3Z257 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm5930D3Z257 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm5930D3Z257 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm5930D3Z257 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm5930D3Z257 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5930D3Z257 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms