Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tgfbr3lD3YZZ2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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