Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms