Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms