Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smok3bC0HKC9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms