Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf11bB4XVQ1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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