Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cfap58B2RW38 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms