Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpb1B2RS76 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms