Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms