Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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AU022751B1B0V2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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AU022751B1B0V2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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AU022751B1B0V2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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AU022751B1B0V2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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AU022751B1B0V2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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AU022751B1B0V2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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AU022751B1B0V2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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AU022751B1B0V2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU022751B1B0V2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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