Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ssxb8B1AY40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ssxb8B1AY40 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ssxb8B1AY40 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ssxb8B1AY40 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ssxb8B1AY40 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ssxb8B1AY40 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb8B1AY40 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ssxb8B1AY40 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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