Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms