Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik3B1AS29 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms