Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tmem235B1AQL3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmem235B1AQL3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmem235B1AQL3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem235B1AQL3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmem235B1AQL3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmem235B1AQL3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tmem235B1AQL3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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