Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms