Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf39A2RT81 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms