Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms