Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn2r25W4VSP2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn2r25W4VSP2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms