Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt16Q9Z2K1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms