Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms