Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp1a4Q9WV27 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms