Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnip1Q9WUU8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms