Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms