Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hic1Q9R1Y5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hic1Q9R1Y5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms