Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Plod2Q9R0B9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod2Q9R0B9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms