Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gpc6Q9R087 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gpc6Q9R087 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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