Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms