Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phtf1Q9QZ09 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms