Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rdh11Q9QYF1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rdh11Q9QYF1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rdh11Q9QYF1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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