Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plxnb3Q9QY40 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plxnb3Q9QY40 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms