Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms