Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms