Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms