Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dkk3Q9QUN9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dkk3Q9QUN9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dkk3Q9QUN9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dkk3Q9QUN9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dkk3Q9QUN9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dkk3Q9QUN9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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