Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoaQ9QUI0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms