Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms