Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Crim1Q9JLL0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Crim1Q9JLL0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms