Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gde1Q9JL56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gde1Q9JL56 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms