Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3aQ9JKX8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms