Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pard6bQ9JK83 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms