Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lmbr1Q9JIT0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms