Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LratQ9JI60 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LratQ9JI60 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms