Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssc4Q9JHE7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms